Трей или "системный лоток" -- это область на панели, где хранится нужная информация, куда приложения помещают свои ярлыки для быстрого доступа и просто удобная вещь. Ubuntu содержит много средств для его настройки. И это приятно, ибо многим пользователям Ubuntu Unity хотелось бы изменить его под себя.

Показывать иконки приложений

Естественно, это не просто "иконки", а некие кнопочки, показывающие статус приложения, позволяющие быстро изменить настройки приложения или сделать его активным. Чтобы включить отображения иконок приложений, нужно выполнить команду

gsettings set com.canonical.Unity.Panel systray-whitelist "['all']"

Вместо all можно перечислить приложения, которые должны отображаться в трее

gsettings set com.canonical.Unity.Panel systray-whitelist "['Wine', 'Skype', 'Pidgin']"

После чего перезапустить Unity (например, перезагрузив систему).

Убрать стандартный индикатор сообщений (конвертик)

Это сделать опять же просто -- нужно удалить пакет indicator-messages.

Из консоли:

sudo apt-get remove indicator-messages

В центре приложений: удалить indicator-messages.

Убрать индикатор статуса пользователя

Делается это аналогично предыдущему индикатору:

sudo apt-get remove indicator-me

Или в центре приложений: удалить indicator-me.

Добавляем классическое меню Ubuntu

Чтобы добавить классическое меню Ubuntu в трей, добавим сторонний ppa, обновим список пакетов и поставим пакет:

sudo apt-add-repository ppa:diesch/testing
sudo apt-get update
sudo apt-get install classicmenu-indicator

Индикатор погоды

Индикатор погоды можно установить из консоли:

sudo apt-get install indicator-weather

Или из центра приложений Ubuntu: установить погодный индикатор.