Bio-Linux — дистрибутив, основанный на Ubuntu, созданный для решения проблем биологов в обработке данных, полученных из экспериментов.
Bio-Linux — прекрасный пример того, как создаются специализированные дистрибутивы на базе Ubuntu. Дистрибутивостроение не предполагает замену логотипа, копирайтов, как это могло показаться на примере Bolgenos и ему подобных. Вместо этого разработчики дистрибутивов стараются решить какую-то конкретную задачу, вставшую пред ними/их близкими. Именно дистрибутивы, созданные для решения проблем, а не ради дешевой славы и находят популярность и применение.
Так Bio-Linux можно использовать для развёртования окружения для биологов. В нём уже установлены программы:
- из области биоинформатики: QIIME, Mothur, Jalview, Artemis, BLAST, Bowtie-Bio и т.д.
- для статистических исследований, основанные на R: ggplot2, DESeq, edgeR, Bioconductor;
- шаблоны для виртуализации VMWare/VirtualBox.
Узнать подробности о проекте можно по ссылке.
Поделиться заметкой: